Die Gemeinde Ekerö erstreckt sich über vier große und rund 130 kleinere Inseln und Schären im östlichen Teil des Mälaren un­mit­tel­bar vor der Stadt­gren­ze von Stockholm. Die Haup­tin­sel Ekerön mit dem glei­ch­na­mi­gen Hauptort der Gemeinde ist über Brücken mit den beiden anderen großen Inseln Färingsö und Lovön verbunden, von letzterer besteht eine Brück­en­ver­bin­dung zum Sto­ck­hol­mer Stadtteil Bromma. Insgesamt elf Na­turs­chutz­ge­bie­te verteilen sich auf die Gemeinde, geprägt ist die Lands­chaft durch niedrige Hügel, an denen mitunter felsiger Un­ter­grund zu Tage tritt. Höchste Erhebung ist die Geröll Moräne Up­psa­laå­sen im Nordosten der Insel Ekerön. Die Kommune trägt der Beinamen „Inselwelt der Kulturen“, da sich hier za­hl­rei­che Kul­tur­denkmä­ler aus allen Epochen der schwe­di­s­chen Ge­s­chi­ch­te finden.